Head of Facility

Ref. No. SU FV-2508-21; Closing date: 15/08/2021

The National Facility for Exposomics is a new pilot facility at Science for Life Laboratory (SciLifeLab) that is hosted by the Department of Environmental Science (ACES), Stockholm University. SciLifeLab is a national research infrastructure with a mission to provide cutting-edge, unique, and enabling molecular technologies to the Swedish research community, including to support large-scale initiatives addressing societal grand challenges.

A PhD-level scientist is sought as ‘Head of Facility’ to manage and develop exposomics services. The exposome concept promises to reveal environmental causes of toxicity and disease, and the chemical component of the exposome is increasingly accessible to scientists through mass spectrometry-based exposomics, including in human biofluids and environmental samples.

High resolution analytical technologies and open science data workflows can now reveal complex environmental exposures throughout the life-course, and the resulting data can now be leveraged in future studies of human and environmental health.

ACES is one of the largest departments in the Faculty of Science. The department is divided into four units with more than 170 researchers, teachers, doctoral students and technical/administrative staff from over 30 countries. Research and teaching focuses on chemical contaminants, atmospheric science, biogeochemistry and (eco)toxicology.

As an employee at the Department of Environmental Science you will be part of a dynamic environment with research in leading research areas and with a strong international profile.

Main responsibilities
Main responsibilities of Head of Facility are to plan and coordinate daily work in the National Facility for Exposomics, to manage interactions with user researchers, and to actively participate in technology development with regards to hardware, analytical methods and software applications. You will work closely with the Facility Scientific Director and the Metabolomics Platform Management Group.

The role as Head of Facility also includes personnel management and regular workplace meetings with facility employees and surrounding research groups in exposomics. Specific responsibilities include the following:

  • Establish projects with external users, communicate facility capabilities and prices, and coordinate project logistics from sample receipt to data delivery.
  • Supervise data acquisition strategies and take leadership in data analysis.
  • Responsibility for data delivery and data security, maintaining documentation, and adhering to best practices in quality assurance and quality control.
  • Allocate budgetary and personnel resources to projects, and manage internal timelines.
  • Lead workshops or contribute to courses to facilitate open science data analysis workflows in exposomics.
  •  Be responsible for staff development, and develop a plan for your own professional development with support from the Facility Scientific Director.
  • Proactively work on facility collaborations, and initiate internal or external grant applications in support of facility infrastructure and technology development.
  •  Actively participate in the Metabolomics Platform Management Group.
  • Establish and maintain working relationships with SciLifeLab National Bioinformatics Infrastructure (NBIS), and SciLifeLab Data Centre.
  • Take initiative for the timely procurement of equipment and resources used at the facility.

Qualification requirements
We are looking for someone with a doctoral degree, and at least one year of post-doctoral research experience in mass-spectrometry based exposomics or metabolomics.

In the appointment process, special attention will be given to strong practical and theoretical knowledge of sample preparation, GC- and LC-based separations, and high-resolution mass spectrometry analysis. It is also required that the candidate has experience in high throughput data processing, identification of molecules by MS2 spectral library matching, and mass spectral interpretation of unknown molecules.

Additional merits include personal qualities such as a positive attitude and ability to communicate in a clear and professional manner with facility staff, users, and collaborators.

Most valuable experiences:

  • Knowledge of programming, including working ability in R and Python.
  • Strong statistical knowledge and experience in multivariate modelling.
  • Demonstrable experience with open science software and resources for mass-spectrometry-based metabolomics or exposomics.
  • Strong communication ability in English, in both speech and writing.

Desirable/merited skills:

  • Genuine interest in leading and creating conditions for realizing the full potential of employees and synergy of the facility with neighbouring research groups and units at SciLifeLab. Experience in project management and working in scientific teams.
  • Very good organizational skills and good independent judgment.
  • Knowledge and understanding of methods and applications in molecular biology and genetics.

Terms of employment
This is a full-time, indefinite-term position with a six-month trial period. Salaries at Stockholm University are determined individually; therefore, please indicate your requested salary. Start date immediately.

Stockholm University strives to be a workplace free from discrimination and with equal opportunities for all.

Further information about the position can be obtained from the Head of the Department, Professor Magnus Breitholtz, telephone: +46 70-600 26 86, magnus.breitholtz@aces.su.se.

Union representatives
Ingrid Lander (Saco-S), telephone: +46 708 16 26 64, saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/Lärarförbundet), telephone: +46 8 16 34 89, alejandra@st.su.se, and seko@seko.su.se (SEKO).

Apply for the position at Stockholm University’s recruitment system. It is the responsibility of the applicant to ensure that the application is complete in accordance with the instructions in the job advertisement, and that it is submitted before the deadline.

Your application should consist of a cover letter, CV, and up to 3 attached files consisting of published or submitted work. Do not include your PhD thesis. The cover letter should be a maximum of 2 pages that describes your qualifications and your stated vision for exposomics services in Sweden. Provide contact information for up to 3 external referees, we will contact these individuals if you are short-listed for the position.

The instructions for applicants are available at: How to apply for a position.

You are welcome to apply!

Stockholm University contributes to the development of sustainable democratic society through knowledge, enlightenment and the pursuit of truth.

Ref. No.: SU FV-2508-21

Closing date: 15/08/2021


På svenska:


vid Institutionen för miljövetenskap.

Sista ansökningsdag: 2021-08-15. Ref.nr SU FV-2508-21.

Facility for Exposomics är en ny pilotanläggning vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab) med Institutionen för miljövetenskap (ACES), Stockholms universitet som värdinstitution. SciLifeLab är en nationell forskningsinfrastruktur med ett uppdrag att etablera banbrytande molekylära teknologier, som skall erbjudas till det svenska forskarsamhället samt möjliggöra och stödja storskaliga initiativ för att bl.a. möta samhällets utmaningar avseende miljö och hälsa.

Vi söker nu en forskare som ”Head of Facility” för att ansvara för och utveckla exposomics-facilitetens tjänster. Exposom-konceptet syftar till att upptäcka miljörelaterade orsaker till hälsoeffekter hos människa och miljö. Genom forskning baserad på avancerad masspektrometri, speciellt genom analys av biologiska prover från människa och miljö, ökar snabbt vår förmåga att upptäcka och karaktärisera den kemiska komponenten i exposomet.

Högupplösande analystekniker och öppet tillgängliga dataarbetsflöden möjliggör att komplexa miljöexponeringar under människans hela livslängd kan kartläggas, vilket i sin tur kan utnyttjas i framtida studier av människors hälsa, liksom av effekter i miljön.

Institutionen för miljövetenskap är en av de större institutionerna inom Naturvetenskapliga fakulteten. Institutionen består av fyra enheter med drygt 170 anställda forskare, lärare, doktorander och teknisk/administrativ personal från mer än 30 olika länder. Forskning och undervisning bedrivs inom miljökemi, atmosfärsvetenskap, biogeokemi och ekotoxikologi.

Som medarbetare på Institutionen för miljövetenskap blir du en del av en dynamisk miljö med forskning av högsta klass och med stark internationell prägel.

Det huvudsakliga ansvaret för anställningen är att planera och samordna det dagliga arbetet i den Nationella Faciliteten för Exposomics, att hantera interaktioner med användare och att delta aktivt i teknikutveckling med avseende på hårdvara, analysmetoder och programvarutillämpningar. Du kommer att ha nära samarbete med Facility Scientific Director och Metabolomics Platform Management Group.

I rollen som chef för anläggningen ingår även personalhantering och regelbundna arbetsplatsmöten med anställda men också forskargrupper som utnyttjar faciliteten. Specifika ansvarsområden inkluderar följande:

  • Upprätta projekt med externa användare, kommunicera anläggningsfunktioner och priser och samordna projektlogistik från provmottagning till dataleverans.
  • Övervaka datainsamlingsstrategier och leda dataanalysarbetet.
  • Ansvara för dataleverens och -säkerhet, upprätthålla dokumentation och följa bästa praxis inom kvalitetssäkring och kvalitetskontroll.
  • Tilldela budget- och personalresurser till projekt och hantera interna tidslinjer.
  • Leda workshops eller bidra till kurser för att underlätta arbetsflöden för öppen vetenskaplig dataanalys i exposomics.
  • Ansvara för personalutveckling och utveckla en plan för din egen professionella utveckling med stöd från Facility Scientific Director.
  • Arbeta proaktivt med anläggningssamarbeten och initiera interna eller externa bidragsansökningar till stöd för anläggningsinfrastruktur och teknikutveckling.
  • Aktivt delta i Metabolomics Platform Management Group.
  • Upprätta och upprätthålla arbetsrelationer med SciLifeLab National Bioinformatics Infrastructure (NBIS) och SciLifeLab Data Center.
  • Medverka vid upphandling av utrustning och resurser som används vid anläggningen.

Vi söker dig som har en doktorsexamen och minst ett års forskningserfarenhet efter doktorsexamen inom masspektrometri-baserad exposomik eller metabolomik.

Vid tillsättningen kommer särskild vikt att fästas vid praktisk och teoretisk kunskap om provberedning, GC- och LC-baserade separationer och analys med högupplösande masspektrometri. Det krävs också att kandidaten har erfarenhet av ”high-throughput” databehandling, identifiering av molekyler genom MS2-spektra biblioteksmatchning och masspektratolkning av okända molekyler.

Ytterligare meriter inkluderar personliga egenskaper som en positiv attityd och förmåga att kommunicera på ett tydligt och professionellt sätt med personal, användare och medarbetare.

Stor vikt kommer att fästas vid:

  • Kunskap om programmering, inklusive arbetsförmåga i R och Python.
  • God kunskap i statistik och erfarenhet av multivariat modellering.
  • Påvisbar erfarenhet av öppen vetenskaplig programvara och resurser för mass-spektrometri-baserade metabolomics eller exposomics.
  • Stark kommunikationsförmåga på engelska, både i tal och skrift.

Önskvärt/meriterande i övrigt:

  • Stort intresse för att leda och skapa förutsättningar för att förverkliga de anställdas fulla potential och synergi för anläggningen med angränsande forskargrupper och enheter på SciLifeLab. Erfarenhet av projektledning och arbete i vetenskapliga team.
  • Mycket bra organisatoriska färdigheter och stor självständighet.
  • Kunskap och förståelse för metoder och tillämpningar inom molekylärbiologi och genetik.

Anställningen avser heltid och gäller tills vidare med sex månaders provanställning. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning, ange därför gärna löneanspråk. Tillträde snarast.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Närmare information om anställningen lämnas av prefekten, professor Magnus Breitholtz, tfn 070-600 26 86, magnus.breitholtz@aces.su.se.

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/Lärarförbundet), tfn 08-16 34 89, alejandra@st.su.se, samt seko@seko.su.se(SEKO).

Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Din ansökan ska bestå av ett personligt brev, CV och upp till 3 bifogade filer bestående av publicerat eller inlämnat arbete. Inkludera inte din doktorsavhandling. Det personliga brevet bör vara högst 2 sidor och innehålla en beskrivning av dina kvalifikationer och din vision för utveckling av exposomics-tjänster i Sverige. Ange kontaktinformation för upp till 3 externa referenspersoner.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.

Välkommen med din ansökan!

Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.

Contact information

Visiting addresses:

Geovetenskapens Hus,
Svante Arrhenius väg 8, Stockholm

Arrheniuslaboratoriet, Svante Arrhenius väg 16, Stockholm (Unit for Toxicological Chemistry)

Mailing address:
Department of Environmental Science
Stockholm University
106 91 Stockholm

Press enquiries should be directed to:

Stella Papadopoulou
Science Communicator
Phone +46 (0)8 674 70 11

Department of Environmental Science
Stockholm university

Department of Environmental Science
Stockholm University
SE-106 91 Stockholm

Geovetenskapens hus,
Svante Arrhenius väg 8, Stockholm

Svante Arrhenius väg 16, Stockholm